Da kommer det ikke som noe sjokk at Atari planlegger oppfølgere. Det som derimot overrasker er at oppfølgeren ikke skal lanseres samtidig som neste film i november. Det ryktes derimot at en spesialversjon av Enter The Matrix, skal være i hyllene i forbindelse med lanseringen av den tredje filmen.
Neste Matrix-spill fra Shiny Entertainment kommer ikke før høsten 2004, og enda et Matrix-spill er ventet i 2006. Disse spillene må ikke forveksles med Matrix Online, som utgis av Ubi Soft. Innholdet i Ataris oppfølger er ikke kunngjort enda.